Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnaaf3Q3UYV8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms