Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim40Q3UWA4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim40Q3UWA4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms