Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pate2Q3UW31 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms