Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms