Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
A530084C06RikQ3UTW2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms