Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a11Q3USY0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a11Q3USY0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms