Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhdc9Q3USL1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms