Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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