Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms