Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Washc4Q3UMB9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms