Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc33Q3ULW6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms