Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrxosQ3UL53 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxosQ3UL53 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms