Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed8Q3UHI4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed8Q3UHI4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed8Q3UHI4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed8Q3UHI4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed8Q3UHI4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed8Q3UHI4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmed8Q3UHI4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmed8Q3UHI4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed8Q3UHI4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms