Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rrp36Q3UFY0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms