Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U6N9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U6N9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms