Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms