Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmf1Q3U3R4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmf1Q3U3R4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmf1Q3U3R4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmf1Q3U3R4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmf1Q3U3R4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmf1Q3U3R4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmf1Q3U3R4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms