Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vars2Q3U2A8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vars2Q3U2A8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vars2Q3U2A8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms