Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc174Q3U155 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc174Q3U155 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc174Q3U155 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms