Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc9Q3U0M1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms