Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88bQ3TYP4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms