Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pip4p1Q3TWL2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pip4p1Q3TWL2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms