Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q3TTL0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTL0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTL0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms