Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxw18Q3TSA9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxw18Q3TSA9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms