Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c3Q3TMP1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms