Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc2cQ3TLH4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms