Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc27Q3TKY6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cwc27Q3TKY6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cwc27Q3TKY6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms