Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Smarca4Q3TKT4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smarca4Q3TKT4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smarca4Q3TKT4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms