Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam107bQ3TGF2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam107bQ3TGF2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms