Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Jmjd8Q3TA59 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Jmjd8Q3TA59 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Jmjd8Q3TA59 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Jmjd8Q3TA59 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Jmjd8Q3TA59 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Jmjd8Q3TA59 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Jmjd8Q3TA59 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Jmjd8Q3TA59 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Jmjd8Q3TA59 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Jmjd8Q3TA59 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms