Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VrtnQ3SYK4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms