Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Treml4Q3LRV9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Treml4Q3LRV9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms