Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Riiad1Q3KNY5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Riiad1Q3KNY5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms