Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax1Q2NKI2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax1Q2NKI2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms