Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmprss11cQ1JRP2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmprss11cQ1JRP2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmprss11cQ1JRP2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmprss11cQ1JRP2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmprss11cQ1JRP2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmprss11cQ1JRP2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmprss11cQ1JRP2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmprss11cQ1JRP2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmprss11cQ1JRP2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms