Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Perm1Q149B8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Perm1Q149B8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Perm1Q149B8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Perm1Q149B8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Perm1Q149B8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms