Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Spatc1Q148B6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Spatc1Q148B6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Spatc1Q148B6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Spatc1Q148B6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Spatc1Q148B6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Spatc1Q148B6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Spatc1Q148B6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spatc1Q148B6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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