Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli2Q0VGT2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli2Q0VGT2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli2Q0VGT2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms