Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc162pQ0VG85 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc162pQ0VG85 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms