Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cntnap5cQ0V8T7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntnap5cQ0V8T7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntnap5cQ0V8T7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntnap5cQ0V8T7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntnap5cQ0V8T7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntnap5cQ0V8T7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntnap5cQ0V8T7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntnap5cQ0V8T7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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