Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrriq1Q0P5X1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lrriq1Q0P5X1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrriq1Q0P5X1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrriq1Q0P5X1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms