Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnnm1Q0GA42 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm1Q0GA42 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm1Q0GA42 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm1Q0GA42 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm1Q0GA42 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm1Q0GA42 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnnm1Q0GA42 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms