Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ncf1Q09014 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncf1Q09014 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ncf1Q09014 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ncf1Q09014 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms