Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cass4Q08EC4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cass4Q08EC4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms