Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp2Q08652 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms