Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb2Q08331 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb2Q08331 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms