Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrstQ06666 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrstQ06666 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SrstQ06666 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms