Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r236Q05A06 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms