Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SryQ05738 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SryQ05738 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SryQ05738 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SryQ05738 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SryQ05738 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SryQ05738 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SryQ05738 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SryQ05738 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SryQ05738 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SryQ05738 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SryQ05738 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SryQ05738 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SryQ05738 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms