Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col9a1Q05722 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a1Q05722 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms